重慶交通大學現設有重點學科:地理學、力學、機械工程、材料科學與工程、計算機科學與技術、土木工程、水利工程、測繪科學與技術、交通運輸工程、船舶與海洋工程、管理科學與工程。
重慶交通大學是一本,是一所交通特色鮮明、以工為主的多科性大學,為交通運輸部與重慶市共建高校。土木工程、港口航道與海岸工程、交通運輸等3個國家特色專業通過工程教育專業認證,水利水電工程等7個專業獲批教育部“卓越工程師教育培養計劃”試點專業,有重慶市“三特行動計劃”特色專業15個、特色學科專業群7個。
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